27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4704 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  807    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  70.81 
 
 
382 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  62.11 
 
 
390 aa  514  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  58.91 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  56.83 
 
 
382 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  53.49 
 
 
411 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  52.89 
 
 
383 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  53.49 
 
 
411 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  53.49 
 
 
411 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  53.03 
 
 
396 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  53.03 
 
 
396 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  53.78 
 
 
383 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  53.03 
 
 
396 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  51.97 
 
 
379 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  54.25 
 
 
352 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  49.74 
 
 
362 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  49.57 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  48.88 
 
 
353 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  39.43 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  38.57 
 
 
356 aa  269  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  38.29 
 
 
357 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  38.29 
 
 
357 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  36.56 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.29 
 
 
772 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  26.18 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  20.4 
 
 
568 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  29.05 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>