27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2851 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  60.63 
 
 
353 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  57.63 
 
 
362 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  54.25 
 
 
388 aa  371  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  48.39 
 
 
390 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  44.68 
 
 
382 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  46.57 
 
 
383 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  44.79 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  45.45 
 
 
411 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  45.45 
 
 
411 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  45.45 
 
 
411 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  44.31 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  44.44 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  44.31 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  44.31 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  43.18 
 
 
414 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  43.38 
 
 
379 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  36.44 
 
 
354 aa  248  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  34.38 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  34.94 
 
 
357 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  34.94 
 
 
357 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  34.73 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.93 
 
 
772 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  24.55 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  18.97 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  22.29 
 
 
601 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>