26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2508 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  76.14 
 
 
356 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  66.86 
 
 
357 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  66.86 
 
 
357 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  39.43 
 
 
388 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  37.43 
 
 
383 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  36.44 
 
 
352 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  37.08 
 
 
382 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  36.18 
 
 
390 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  37.29 
 
 
362 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  35.13 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  36.46 
 
 
383 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  35.01 
 
 
396 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  35.01 
 
 
396 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  35.01 
 
 
396 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  34.71 
 
 
382 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  34.65 
 
 
353 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  34.76 
 
 
379 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  34.28 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  34.28 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  34.28 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  33.24 
 
 
414 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  28.95 
 
 
447 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  29.81 
 
 
772 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  22.22 
 
 
568 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  33.03 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>