27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3415 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  839    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  53.82 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  53.82 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  50.92 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  53.82 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  52.36 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  52.76 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  52.46 
 
 		 411 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  52.46 
 
 		 411 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  52.46 
 
 		 411 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  52.87 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  49 
 
 		 388 aa  360  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  50.14 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  50.14 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  46.53 
 
 		 390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  43.18 
 
 		 352 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  42.73 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  40.86 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  34.66 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  35.15 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  33.24 
 
 		 354 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  34.07 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  34.07 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.07 
 
 		 772 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  27.31 
 
 		 343 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  23.39 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  24.3 
 
 		 568 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>