65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2374 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  100 
 
 
772 aa  1575    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  30.99 
 
 
382 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  32.16 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  32.16 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  31.79 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  29.27 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  29.39 
 
 
383 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  29.52 
 
 
353 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  27.51 
 
 
390 aa  127  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  28.9 
 
 
382 aa  126  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  30 
 
 
411 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  30 
 
 
411 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  28.29 
 
 
388 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  30 
 
 
411 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  28.82 
 
 
383 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  28.93 
 
 
352 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  31.09 
 
 
379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  28.53 
 
 
383 aa  119  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  28.07 
 
 
414 aa  109  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  25.8 
 
 
356 aa  94  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  31.25 
 
 
447 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  25.86 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  25.86 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  29.81 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  34.31 
 
 
1141 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  34.59 
 
 
841 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  34.59 
 
 
644 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  32.59 
 
 
613 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  32.56 
 
 
978 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  34.11 
 
 
1206 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.21 
 
 
4465 aa  67.8  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  27.91 
 
 
343 aa  67  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.07 
 
 
1504 aa  64.3  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.23 
 
 
14944 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 
361 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  32 
 
 
578 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  27.56 
 
 
838 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.52 
 
 
2334 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  31.31 
 
 
584 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 
995 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  33.08 
 
 
581 aa  55.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  30 
 
 
849 aa  55.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.19 
 
 
558 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  28.92 
 
 
2215 aa  52.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  28.41 
 
 
918 aa  52  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0164  protective antigen  23.74 
 
 
764 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  29.7 
 
 
904 aa  51.6  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.38 
 
 
889 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  25.68 
 
 
969 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.27 
 
 
1293 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  27.52 
 
 
886 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.12 
 
 
855 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  23.71 
 
 
882 aa  47.8  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  26.81 
 
 
1172 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  32.48 
 
 
2447 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  26.73 
 
 
1314 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  29.55 
 
 
423 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  40 
 
 
578 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.93 
 
 
1064 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  30.77 
 
 
881 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  31.62 
 
 
1217 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  25.88 
 
 
425 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.1 
 
 
1236 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0891  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 
582 aa  45.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.977532  normal  0.103657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  30.43 
 
 
2252 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>