26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34543 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  100 
 
 
447 aa  925    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  37.19 
 
 
388 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  35.77 
 
 
383 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  36.22 
 
 
382 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  34.26 
 
 
390 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  36.44 
 
 
411 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  36.44 
 
 
411 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  36.44 
 
 
411 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  35.15 
 
 
414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  34.73 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  35.07 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  37.3 
 
 
383 aa  212  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  37.23 
 
 
383 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  35.15 
 
 
396 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  35.15 
 
 
396 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  35.15 
 
 
396 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  33.78 
 
 
353 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  35.23 
 
 
379 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  32.43 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  29.97 
 
 
357 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  29.97 
 
 
357 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  30.54 
 
 
356 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  28.95 
 
 
354 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  31.25 
 
 
772 aa  90.5  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  29.73 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  28.57 
 
 
640 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>