32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1094 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  876    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  25.2 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  21.56 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0259  glycoside hydrolase family 42 protein  25.3 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0628186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0285  glycoside hydrolase family 42 protein  26.1 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696362  hitchhiker  0.00613688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  22.4 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  23.39 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  22.65 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  21.5 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  22.64 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  22.64 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  22.64 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.92 
 
 		 603 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  20.35 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  21.89 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  22.07 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  22.9 
 
 		 627 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.73 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  29.73 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  37.33 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  20.82 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  25.88 
 
 		 772 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  18.97 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  20.06 
 
 		 357 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  20.06 
 
 		 357 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>