17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2257 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  916    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  52.01 
 
 
443 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  50.12 
 
 
415 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  48.79 
 
 
406 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  45.97 
 
 
405 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  46.46 
 
 
419 aa  349  6e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  44.39 
 
 
410 aa  345  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  42.23 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  43.7 
 
 
425 aa  328  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  24.79 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.76 
 
 
635 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  21.28 
 
 
627 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  25.08 
 
 
640 aa  60.1  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  23.75 
 
 
600 aa  57  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  30.52 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  28.1 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>