15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0285 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0285  glycoside hydrolase family 42 protein  100 
 
 		 383 aa  782    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696362  hitchhiker  0.00613688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0259  glycoside hydrolase family 42 protein  84.33 
 
 		 380 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0628186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  24.45 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1094  hypothetical protein  26.28 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  20.95 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.72 
 
 		 551 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  21.99 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.79 
 
 		 673 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 		 627 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  23.27 
 
 		 763 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.32 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  24.72 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  25.59 
 
 		 749 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  24.68 
 
 		 604 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  25.15 
 
 		 383 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>