28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2643 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  794    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  66.23 
 
 
388 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  61.49 
 
 
390 aa  474  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  60 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  55.12 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  53.6 
 
 
411 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  53.6 
 
 
411 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  51.48 
 
 
383 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  53.6 
 
 
411 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  52.46 
 
 
396 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  52.46 
 
 
396 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  52.46 
 
 
396 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  53.2 
 
 
383 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  51.74 
 
 
379 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  50.14 
 
 
414 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  47.58 
 
 
352 aa  349  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  49.33 
 
 
362 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  47.15 
 
 
353 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  38.14 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  37.32 
 
 
357 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  37.32 
 
 
357 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  37.64 
 
 
354 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  35.5 
 
 
447 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.9 
 
 
772 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  25.86 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  21.74 
 
 
568 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  23.81 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  23.39 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.307067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>