26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5326 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5326  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  814    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5415  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  814    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5705  hypothetical protein  99.75 
 
 
396 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13113  hypothetical protein  72.92 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.647658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5269  hypothetical protein  69.73 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5358  hypothetical protein  69.73 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5648  hypothetical protein  69.73 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5801  hypothetical protein  65.05 
 
 
383 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1032  hypothetical protein  64.08 
 
 
383 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374655  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0317  hypothetical protein  52.66 
 
 
383 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  53.03 
 
 
388 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2022  hypothetical protein  49.48 
 
 
390 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3082  hypothetical protein  48.44 
 
 
382 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2643  hypothetical protein  52.46 
 
 
382 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3415  hypothetical protein  54.02 
 
 
414 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.497108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0506  hypothetical protein  40.21 
 
 
362 aa  308  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.440282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2851  hypothetical protein  44.22 
 
 
352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000654972  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1465  hypothetical protein  41.58 
 
 
353 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002665  hypothetical protein  35.39 
 
 
356 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2508  hypothetical protein  35.01 
 
 
354 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0780  hypothetical protein  34.93 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0708  hypothetical protein  34.93 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34543  predicted protein  35.05 
 
 
447 aa  209  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  32.16 
 
 
772 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  26.09 
 
 
568 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3479  hypothetical protein  25.46 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>