38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1581 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  100 
 
 		 969 aa  2009    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  28.37 
 
 		 828 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.65 
 
 		 1206 aa  121  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.19 
 
 		 1236 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  31.16 
 
 		 2334 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.51 
 
 		 558 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  32.68 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  49.25 
 
 		 578 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  31.21 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.9 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.4 
 
 		 766 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.33 
 
 		 765 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.08 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  25 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  24.21 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  29.37 
 
 		 595 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  23.92 
 
 		 628 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.43 
 
 		 1072 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.65 
 
 		 478 aa  52.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 964 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  36.71 
 
 		 3802 aa  51.6  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  32.99 
 
 		 1382 aa  50.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2745  hypothetical protein  22.69 
 
 		 396 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2650  cytochrome c, class I  23.47 
 
 		 225 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  25.68 
 
 		 772 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  27.03 
 
 		 719 aa  49.3  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  34.48 
 
 		 373 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1351 aa  48.9  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.14 
 
 		 964 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 		 482 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.89 
 
 		 950 aa  48.1  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  25.84 
 
 		 354 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 995 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3383  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 120 aa  47  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  23.12 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  25.1 
 
 		 579 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  22.76 
 
 		 140 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>