30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1348 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  100 
 
 		 581 aa  1176    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  32.7 
 
 		 762 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  30.58 
 
 		 309 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  29.92 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  28.25 
 
 		 693 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  31.72 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  27.34 
 
 		 675 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  30.42 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  34.96 
 
 		 4465 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.71 
 
 		 1293 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.95 
 
 		 14944 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.68 
 
 		 886 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  32.74 
 
 		 2215 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  33.08 
 
 		 772 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  25.93 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  27.22 
 
 		 918 aa  53.9  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  31 
 
 		 1504 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  25.58 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  33.61 
 
 		 841 aa  50.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  32.41 
 
 		 1206 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  24.51 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  23.57 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  25.74 
 
 		 1141 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.18 
 
 		 802 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 831 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  22.63 
 
 		 3802 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  26.98 
 
 		 914 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  25.74 
 
 		 904 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>