22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3991 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  100 
 
 
1217 aa  2488    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3980  hypothetical protein  38.04 
 
 
694 aa  446  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0435811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  38.49 
 
 
818 aa  162  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  32.27 
 
 
1220 aa  102  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  29.08 
 
 
1267 aa  92  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.53 
 
 
851 aa  73.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  33.33 
 
 
738 aa  72.4  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  35.62 
 
 
681 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  28.03 
 
 
838 aa  66.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  30.77 
 
 
705 aa  60.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.77 
 
 
1418 aa  58.5  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
613 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  27.54 
 
 
559 aa  55.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 
855 aa  55.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.51 
 
 
957 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.89 
 
 
951 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  30.67 
 
 
772 aa  52  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  24.66 
 
 
613 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  32.43 
 
 
911 aa  48.5  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
3197 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2506  hypothetical protein  26.26 
 
 
738 aa  46.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  34.78 
 
 
803 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>