115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1319 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1319  levanase  100 
 
 
705 aa  1435    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  49.68 
 
 
1203 aa  328  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  44.96 
 
 
851 aa  324  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  51.36 
 
 
526 aa  304  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  52.69 
 
 
511 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  51.34 
 
 
572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  46.45 
 
 
566 aa  290  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  51.9 
 
 
544 aa  290  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  52.77 
 
 
557 aa  287  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  49.04 
 
 
545 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  49.04 
 
 
545 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  48.08 
 
 
545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  50.35 
 
 
554 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  50.35 
 
 
554 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  50.35 
 
 
554 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  50.35 
 
 
554 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  51.29 
 
 
554 aa  283  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  51.29 
 
 
554 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  50.92 
 
 
554 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  45.54 
 
 
507 aa  270  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  47.55 
 
 
546 aa  261  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  49.63 
 
 
497 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  45.35 
 
 
507 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  48.73 
 
 
531 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  49.07 
 
 
506 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  47.6 
 
 
738 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  43.32 
 
 
551 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  38.61 
 
 
507 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  44.94 
 
 
473 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  38.58 
 
 
440 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  39.57 
 
 
472 aa  207  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  39.48 
 
 
576 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  40.43 
 
 
519 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  36.91 
 
 
818 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  38.08 
 
 
1413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  39.8 
 
 
1220 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  40.07 
 
 
1267 aa  173  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.1 
 
 
1418 aa  161  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  34.22 
 
 
664 aa  160  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  37.69 
 
 
489 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  34.6 
 
 
652 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.32 
 
 
473 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  30.89 
 
 
432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  31.23 
 
 
432 aa  141  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  36.36 
 
 
480 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.12 
 
 
491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  37.23 
 
 
492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.88 
 
 
491 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.16 
 
 
493 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.6 
 
 
493 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  32.39 
 
 
553 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  32.85 
 
 
740 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.86 
 
 
480 aa  127  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.51 
 
 
480 aa  124  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.51 
 
 
480 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  44.44 
 
 
681 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31 
 
 
787 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.76 
 
 
705 aa  117  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.71 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.07 
 
 
470 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  33.2 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.16 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  32.78 
 
 
476 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.59 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.69 
 
 
491 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.69 
 
 
491 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.69 
 
 
491 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  31.95 
 
 
491 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  31.95 
 
 
491 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.08 
 
 
518 aa  107  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.62 
 
 
454 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.47 
 
 
487 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.69 
 
 
523 aa  104  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.78 
 
 
482 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  28.82 
 
 
451 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.33 
 
 
754 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.91 
 
 
469 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.05 
 
 
545 aa  101  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.35 
 
 
469 aa  101  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.31 
 
 
464 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.69 
 
 
511 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.28 
 
 
476 aa  97.8  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.45 
 
 
481 aa  97.4  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  30.48 
 
 
473 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.79 
 
 
469 aa  97.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.2 
 
 
496 aa  94.4  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  35.22 
 
 
467 aa  94  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  32.49 
 
 
469 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.94 
 
 
566 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.15 
 
 
415 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.43 
 
 
430 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  28.95 
 
 
546 aa  89  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03837  Glycosyl hydrolases family 32 superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G05000)  35.03 
 
 
646 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.64 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.64 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.24 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0712  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.25 
 
 
525 aa  83.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00405775  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6115  glycosyl hydrolase family 32 protein  40.52 
 
 
156 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179958  normal  0.162592 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.43 
 
 
484 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.11 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>