116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1284 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  100 
 
 		 473 aa  967    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  46.37 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  46.24 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  46.15 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  45.95 
 
 		 470 aa  359  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  44.23 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  44.35 
 
 		 469 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  44.47 
 
 		 469 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  42.79 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  42.37 
 
 		 467 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  32.9 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.12 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  38.6 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.29 
 
 		 494 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.29 
 
 		 494 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  38.6 
 
 		 491 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.15 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.15 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.15 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.14 
 
 		 490 aa  310  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.4 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  43.62 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.83 
 
 		 545 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.25 
 
 		 491 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.8 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.29 
 
 		 493 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.64 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  37.86 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.36 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  37.64 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.39 
 
 		 493 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  36.43 
 
 		 546 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  35.44 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.12 
 
 		 499 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.2 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.75 
 
 		 496 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  34.34 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.26 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.69 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.9 
 
 		 518 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.5 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.88 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.02 
 
 		 480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.64 
 
 		 705 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  33.33 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  33.1 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.68 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  29.44 
 
 		 740 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  26.44 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.39 
 
 		 479 aa  176  6e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.77 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  29.27 
 
 		 738 aa  164  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  37.42 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.21 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  32.82 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.54 
 
 		 787 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.03 
 
 		 523 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  30.69 
 
 		 526 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.9 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  28.54 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  28.01 
 
 		 576 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.96 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  30.02 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.08 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  28.1 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  29.34 
 
 		 557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  27.09 
 
 		 507 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.45 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.56 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  29.52 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  29.52 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  28.57 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  26.91 
 
 		 1413 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  26.6 
 
 		 519 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  28.37 
 
 		 1203 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  30.06 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  28.89 
 
 		 545 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  28.99 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  28.57 
 
 		 1220 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  28.84 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  27.08 
 
 		 554 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  27.08 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  27.08 
 
 		 554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.18 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  26.88 
 
 		 554 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  26.88 
 
 		 554 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  26.88 
 
 		 554 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  26.88 
 
 		 554 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  26.9 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  25.3 
 
 		 507 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.02 
 
 		 754 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  28.81 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  27.49 
 
 		 664 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  27.25 
 
 		 551 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  28.34 
 
 		 652 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.94 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.38 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  29.97 
 
 		 1267 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  27.93 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>