114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0425 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0425  levanase  100 
 
 
497 aa  1021    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  58.57 
 
 
511 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  54.76 
 
 
526 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  47.79 
 
 
544 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  47.95 
 
 
557 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  46.93 
 
 
554 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  48.01 
 
 
545 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  46.93 
 
 
554 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  47.2 
 
 
546 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  46.52 
 
 
554 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  47.81 
 
 
545 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  48.04 
 
 
572 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  46.52 
 
 
554 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  46.52 
 
 
554 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  46.72 
 
 
554 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  46.52 
 
 
554 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  48.21 
 
 
545 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  47.84 
 
 
566 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  42.8 
 
 
507 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  42.92 
 
 
551 aa  359  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  39.81 
 
 
1203 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  40.89 
 
 
506 aa  346  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  41.32 
 
 
473 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  38.81 
 
 
507 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.85 
 
 
507 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  40.94 
 
 
738 aa  320  5e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  38.93 
 
 
531 aa  312  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  58.78 
 
 
851 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  40.54 
 
 
472 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  37.81 
 
 
576 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  36.25 
 
 
1413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.36 
 
 
473 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  37.96 
 
 
1220 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  49.63 
 
 
705 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  37.86 
 
 
440 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  36.44 
 
 
664 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  33.94 
 
 
519 aa  236  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  33.8 
 
 
652 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  40.94 
 
 
1267 aa  226  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.21 
 
 
1418 aa  217  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  33.67 
 
 
681 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  32.6 
 
 
492 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.49 
 
 
491 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.54 
 
 
818 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.54 
 
 
491 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.58 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.51 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  31.01 
 
 
740 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.58 
 
 
480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.09 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.32 
 
 
480 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.88 
 
 
487 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  29.28 
 
 
489 aa  163  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  30.04 
 
 
480 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  30.92 
 
 
476 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  30.72 
 
 
476 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.2 
 
 
493 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  28.43 
 
 
432 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  29.3 
 
 
432 aa  156  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.72 
 
 
545 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.93 
 
 
518 aa  150  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.38 
 
 
511 aa  150  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.25 
 
 
499 aa  143  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.2 
 
 
523 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.39 
 
 
491 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.12 
 
 
469 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  27.79 
 
 
491 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.98 
 
 
491 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.98 
 
 
491 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  27.59 
 
 
491 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  26.54 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.06 
 
 
470 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.15 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.15 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.66 
 
 
705 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.63 
 
 
574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.69 
 
 
482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.27 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  28.24 
 
 
553 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  27.25 
 
 
546 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.33 
 
 
469 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.68 
 
 
469 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  28.84 
 
 
473 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.92 
 
 
470 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.44 
 
 
490 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.3 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.28 
 
 
787 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.67 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.56 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.21 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.52 
 
 
483 aa  103  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.59 
 
 
566 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  26.29 
 
 
469 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.65 
 
 
479 aa  100  5e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.51 
 
 
496 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  23.97 
 
 
467 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.08 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.75 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0712  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.84 
 
 
525 aa  95.1  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00405775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  27.88 
 
 
476 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>