113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3116 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  67.3 
 
 		 480 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  99.37 
 
 		 476 aa  985    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  100 
 
 		 476 aa  990    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  67.09 
 
 		 480 aa  689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  55.86 
 
 		 480 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  48.44 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  47.23 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  46.93 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.83 
 
 		 518 aa  333  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.6 
 
 		 491 aa  329  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  41.35 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  41.24 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.48 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  39.59 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  37.23 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  41.33 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  33.33 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.8 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.92 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.12 
 
 		 499 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  32.69 
 
 		 491 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.91 
 
 		 491 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.12 
 
 		 491 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.91 
 
 		 491 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  40 
 
 		 491 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  34.87 
 
 		 487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.12 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.63 
 
 		 545 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.91 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.39 
 
 		 469 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  37.86 
 
 		 473 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  31.26 
 
 		 487 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.41 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.48 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.63 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.63 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.33 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  34.23 
 
 		 546 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  33.41 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  33.41 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.63 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  33.49 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.15 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.3 
 
 		 532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  33.33 
 
 		 740 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.11 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.18 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.61 
 
 		 787 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  31.73 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.98 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  27.78 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.06 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.78 
 
 		 511 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  28.72 
 
 		 738 aa  179  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  29.14 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.6 
 
 		 523 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.96 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.23 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  28.27 
 
 		 507 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  31.38 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  30.48 
 
 		 1220 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  28.76 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  32.19 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  30.36 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.6 
 
 		 507 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  28.88 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.2 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  30.32 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.75 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  28.54 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  29.4 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.97 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  28.4 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.49 
 
 		 574 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.18 
 
 		 1413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  28.87 
 
 		 1203 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  28.94 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  28.94 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.63 
 
 		 566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  28.8 
 
 		 545 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  28.43 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  28.43 
 
 		 554 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  27.41 
 
 		 544 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.29 
 
 		 754 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  28.14 
 
 		 566 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  28.23 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  28.23 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  28.23 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  28.23 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  31.67 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.89 
 
 		 1418 aa  144  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  28.23 
 
 		 554 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.27 
 
 		 818 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  27.32 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.46 
 
 		 427 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  33.02 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  27.36 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  28.6 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.27 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  30.81 
 
 		 1267 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>