114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0404 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0404  levanase  100 
 
 
1267 aa  2501    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  70.66 
 
 
1220 aa  1712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  33.78 
 
 
531 aa  260  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.72 
 
 
506 aa  251  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  35.29 
 
 
738 aa  249  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  34.97 
 
 
544 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  34.57 
 
 
497 aa  247  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  34.37 
 
 
572 aa  245  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  34.63 
 
 
557 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  33.88 
 
 
554 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  33.88 
 
 
554 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  33.88 
 
 
554 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  33.88 
 
 
554 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  34.58 
 
 
545 aa  242  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  35.28 
 
 
511 aa  241  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  34.39 
 
 
545 aa  240  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  34.62 
 
 
545 aa  240  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  33.64 
 
 
554 aa  240  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  33.64 
 
 
554 aa  239  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.54 
 
 
1413 aa  239  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  32.87 
 
 
566 aa  238  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.02 
 
 
818 aa  238  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  33.45 
 
 
554 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.02 
 
 
473 aa  236  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  33.66 
 
 
473 aa  235  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  30.93 
 
 
546 aa  232  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  34.6 
 
 
1203 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  34.23 
 
 
507 aa  230  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  32.5 
 
 
507 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  33.15 
 
 
551 aa  228  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  30.04 
 
 
576 aa  226  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  33.15 
 
 
526 aa  225  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.52 
 
 
507 aa  224  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.32 
 
 
1418 aa  212  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  33.13 
 
 
472 aa  209  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  31.09 
 
 
652 aa  198  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  31.76 
 
 
664 aa  187  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  29.43 
 
 
489 aa  174  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 
440 aa  174  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  40.07 
 
 
705 aa  173  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  42.91 
 
 
851 aa  168  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  29.48 
 
 
681 aa  168  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.42 
 
 
518 aa  158  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  28.04 
 
 
476 aa  157  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  29.67 
 
 
519 aa  156  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.57 
 
 
480 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.34 
 
 
480 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  27.9 
 
 
476 aa  155  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  30.16 
 
 
492 aa  153  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.05 
 
 
454 aa  148  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.58 
 
 
491 aa  145  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.9 
 
 
487 aa  145  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  28.04 
 
 
740 aa  145  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.22 
 
 
480 aa  144  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.31 
 
 
493 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.12 
 
 
493 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  26.29 
 
 
432 aa  139  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.54 
 
 
705 aa  139  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  26.87 
 
 
432 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.8 
 
 
491 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.51 
 
 
499 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.8 
 
 
490 aa  126  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.36 
 
 
545 aa  123  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  25 
 
 
491 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.2 
 
 
491 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  25 
 
 
491 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  25.2 
 
 
491 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  27.22 
 
 
473 aa  115  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  25 
 
 
491 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  26.57 
 
 
480 aa  109  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.93 
 
 
469 aa  108  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.21 
 
 
484 aa  108  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.09 
 
 
482 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  29.88 
 
 
553 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.53 
 
 
469 aa  105  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.58 
 
 
470 aa  105  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  25.9 
 
 
467 aa  104  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.42 
 
 
481 aa  104  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  25.52 
 
 
546 aa  103  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.63 
 
 
494 aa  103  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.63 
 
 
494 aa  103  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.37 
 
 
574 aa  103  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  28.9 
 
 
421 aa  102  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  26 
 
 
469 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  26.27 
 
 
523 aa  99.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.3 
 
 
470 aa  95.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.88 
 
 
511 aa  94.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.43 
 
 
787 aa  94.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  21.93 
 
 
487 aa  92.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.39 
 
 
532 aa  92  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1408  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.53 
 
 
503 aa  92  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.73 
 
 
469 aa  90.9  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.55 
 
 
479 aa  90.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.28 
 
 
487 aa  90.1  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.58 
 
 
754 aa  88.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.68 
 
 
480 aa  87.8  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.3 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.48 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  29.08 
 
 
1217 aa  82.4  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.36 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>