112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3823 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3823  levanase  100 
 
 		 531 aa  1106    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  47.55 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  47 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  42.53 
 
 		 738 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  37.6 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  35.71 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  35.9 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  36.49 
 
 		 554 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  35.76 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  35.76 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  35.76 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  36.49 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  35.76 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  37.3 
 
 		 544 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  36.29 
 
 		 554 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  38.73 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  35.16 
 
 		 545 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  35.73 
 
 		 545 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  34.97 
 
 		 545 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  36.22 
 
 		 546 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  37.37 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  36.73 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  38.1 
 
 		 526 aa  301  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  36.07 
 
 		 551 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  34.36 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  36.03 
 
 		 1203 aa  276  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  35.71 
 
 		 472 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  33.92 
 
 		 576 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  33.78 
 
 		 1267 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  32.61 
 
 		 1220 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  48.73 
 
 		 705 aa  248  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 440 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  31.09 
 
 		 652 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  44.91 
 
 		 851 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  30.65 
 
 		 664 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  30.67 
 
 		 519 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.74 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.28 
 
 		 491 aa  210  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.88 
 
 		 1413 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.49 
 
 		 1418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  30.18 
 
 		 432 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  31.57 
 
 		 492 aa  183  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  29.34 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.52 
 
 		 818 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.24 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  29.14 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.06 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  30.12 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  27.95 
 
 		 740 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.06 
 
 		 493 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  30.36 
 
 		 681 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.17 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.98 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.46 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.95 
 
 		 480 aa  170  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  29.59 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  29.46 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.81 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  28.54 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  28.83 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.54 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.54 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.34 
 
 		 491 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.74 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.13 
 
 		 470 aa  144  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.05 
 
 		 705 aa  143  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.34 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  26.22 
 
 		 451 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.44 
 
 		 787 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.17 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  27.5 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.64 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.63 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.03 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.08 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.39 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.53 
 
 		 754 aa  133  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.98 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.48 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.56 
 
 		 482 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  26.61 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  26 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.49 
 
 		 469 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.64 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  23.5 
 
 		 487 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  26.9 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.15 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.9 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.9 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.46 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  27.47 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.23 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.86 
 
 		 490 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.64 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.86 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  28.07 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  24.71 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.47 
 
 		 480 aa  98.2  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.4 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>