112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2908 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  68.95 
 
 
469 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  100 
 
 
467 aa  981    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  57.02 
 
 
469 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  56.68 
 
 
470 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  56.55 
 
 
470 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  55.29 
 
 
469 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  54 
 
 
469 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  45.35 
 
 
481 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  42.37 
 
 
473 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.76 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.32 
 
 
491 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.32 
 
 
491 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  37.32 
 
 
491 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.6 
 
 
545 aa  312  9e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  37.24 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
487 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.61 
 
 
487 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.34 
 
 
490 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  38.56 
 
 
546 aa  293  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.31 
 
 
480 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.38 
 
 
487 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.65 
 
 
480 aa  289  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  37.23 
 
 
476 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  37.23 
 
 
476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.59 
 
 
494 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.59 
 
 
494 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.74 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  38.12 
 
 
421 aa  283  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.78 
 
 
464 aa  282  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  34.36 
 
 
496 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.51 
 
 
484 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.07 
 
 
480 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.93 
 
 
532 aa  255  9e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.37 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.53 
 
 
493 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  34 
 
 
480 aa  249  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  37.72 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.69 
 
 
479 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.87 
 
 
489 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.57 
 
 
491 aa  232  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  34.71 
 
 
491 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.98 
 
 
499 aa  227  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.67 
 
 
483 aa  203  6e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  32.74 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  32.59 
 
 
432 aa  196  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.85 
 
 
479 aa  192  9e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  30.86 
 
 
451 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.33 
 
 
482 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.62 
 
 
518 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.75 
 
 
705 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  30.4 
 
 
480 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  30.41 
 
 
740 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.13 
 
 
430 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  32.39 
 
 
523 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.75 
 
 
511 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.91 
 
 
427 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  26.59 
 
 
507 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.61 
 
 
787 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.15 
 
 
464 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  28.02 
 
 
511 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  27.45 
 
 
526 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  26.58 
 
 
476 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  29.96 
 
 
473 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  26.57 
 
 
738 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.09 
 
 
507 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.66 
 
 
506 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  27.38 
 
 
572 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  26.67 
 
 
545 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.71 
 
 
566 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  24.95 
 
 
576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  26.88 
 
 
1413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  26.46 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  27.47 
 
 
531 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  25.7 
 
 
553 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  27.4 
 
 
566 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  26.21 
 
 
1220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  26.88 
 
 
545 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  27.6 
 
 
507 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.43 
 
 
754 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  25.91 
 
 
415 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.43 
 
 
473 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  26.77 
 
 
472 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.51 
 
 
574 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  26.07 
 
 
544 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  25.57 
 
 
557 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  25.9 
 
 
1267 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.74 
 
 
851 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  26.32 
 
 
554 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  26.32 
 
 
554 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  24.75 
 
 
546 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  24.16 
 
 
1203 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  26.1 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  26.1 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  26.1 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  26.1 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  27.03 
 
 
818 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  26.05 
 
 
554 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  25.2 
 
 
497 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  35.22 
 
 
705 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>