105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7034 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7034  levanase  100 
 
 		 681 aa  1383    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  39.57 
 
 		 664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  37.5 
 
 		 652 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  34.29 
 
 		 738 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  32.57 
 
 		 557 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  32.56 
 
 		 544 aa  220  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  32.49 
 
 		 554 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  32.49 
 
 		 554 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  32.49 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  32.49 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  32.49 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  32.49 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.38 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  32.26 
 
 		 572 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  31.95 
 
 		 554 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  31.16 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  31.16 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  31.34 
 
 		 545 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  31.24 
 
 		 566 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  33.87 
 
 		 497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  30.04 
 
 		 507 aa  194  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  30.2 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.29 
 
 		 507 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  29.3 
 
 		 546 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  31.15 
 
 		 1220 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  30.62 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  30.15 
 
 		 531 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  30.04 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.31 
 
 		 1413 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  27.66 
 
 		 551 aa  170  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  30.45 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  31.33 
 
 		 472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  29.85 
 
 		 1267 aa  167  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  28.73 
 
 		 1203 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.57 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.8 
 
 		 1418 aa  162  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.42 
 
 		 818 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  27.8 
 
 		 576 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  30.42 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 440 aa  128  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  44.44 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.45 
 
 		 851 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0712  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.04 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00405775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  25.88 
 
 		 489 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  27.55 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.28 
 
 		 491 aa  114  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.45 
 
 		 480 aa  106  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  26.49 
 
 		 740 aa  104  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.45 
 
 		 480 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  25.1 
 
 		 476 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  25.25 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.31 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1408  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.91 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.95 
 
 		 499 aa  95.5  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.21 
 
 		 454 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.98 
 
 		 480 aa  90.9  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.17 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  23 
 
 		 487 aa  88.2  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.82 
 
 		 491 aa  87.8  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  24.04 
 
 		 491 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  21.76 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.61 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.9 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.19 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.19 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  24.14 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.68 
 
 		 705 aa  84  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.11 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.82 
 
 		 754 aa  80.5  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  24.31 
 
 		 432 aa  80.5  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  25.51 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.18 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  20.68 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.9 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  24.09 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.31 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.48 
 
 		 494 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.48 
 
 		 494 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.51 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.23 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.45 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.68 
 
 		 566 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.92 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.99 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  24.14 
 
 		 523 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1217 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  24.49 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.48 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.41 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.22 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.55 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.35 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2506  hypothetical protein  29.83 
 
 		 738 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.14 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  21.99 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  22.99 
 
 		 467 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  22.74 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  26.94 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6115  glycosyl hydrolase family 32 protein  32.03 
 
 		 156 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179958  normal  0.162592 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  21.17 
 
 		 479 aa  52.4  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>