53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6115 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6115  glycosyl hydrolase family 32 protein  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179958  normal  0.162592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  71.54 
 
 		 546 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  71.68 
 
 		 544 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  64.23 
 
 		 554 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  63.41 
 
 		 557 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  62.28 
 
 		 572 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  61.4 
 
 		 566 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  58.54 
 
 		 545 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  58.54 
 
 		 545 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  58.54 
 
 		 545 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  44.35 
 
 		 551 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  41.74 
 
 		 851 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  42.59 
 
 		 705 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  37.74 
 
 		 511 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  37.86 
 
 		 526 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  34.45 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  37.5 
 
 		 506 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.39 
 
 		 1418 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  38.55 
 
 		 507 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.67 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  37.93 
 
 		 497 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  34.45 
 
 		 1220 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  32.03 
 
 		 681 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  26.28 
 
 		 738 aa  54.7  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.33 
 
 		 493 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  30.93 
 
 		 1203 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  40.68 
 
 		 652 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  36.63 
 
 		 473 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  32.67 
 
 		 1267 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.21 
 
 		 493 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.23 
 
 		 487 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.19 
 
 		 480 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.18 
 
 		 490 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  42.37 
 
 		 664 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  38.46 
 
 		 476 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.3 
 
 		 491 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  38.46 
 
 		 476 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  28.26 
 
 		 531 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.82 
 
 		 507 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.18 
 
 		 494 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.18 
 
 		 494 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.16 
 
 		 518 aa  47.4  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.3 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.93 
 
 		 480 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  34.57 
 
 		 507 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  26.6 
 
 		 1413 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30 
 
 		 787 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>