115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0885 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 		 493 aa  1012    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  88.41 
 
 		 493 aa  919    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  60.12 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  47.15 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  47.02 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  47.23 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  44.02 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  43.15 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.45 
 
 		 491 aa  342  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.82 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.66 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  40.51 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  38.09 
 
 		 469 aa  276  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.93 
 
 		 470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.91 
 
 		 499 aa  273  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.61 
 
 		 469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.16 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.16 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  37.66 
 
 		 470 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  34.39 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  38.29 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  34.18 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  35.02 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.4 
 
 		 487 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  36.92 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.58 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  37.53 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.12 
 
 		 545 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  37.34 
 
 		 469 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.33 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.97 
 
 		 487 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.85 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  33.85 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.54 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  36.28 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  28.11 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.74 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.41 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.34 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  37.22 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  34 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.21 
 
 		 705 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.85 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.45 
 
 		 480 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  33.56 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.91 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  28.73 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  40.37 
 
 		 421 aa  204  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  34.44 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.82 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.93 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.76 
 
 		 787 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  31.2 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  30.8 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  30.8 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  30.8 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  30.8 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  30 
 
 		 479 aa  181  4e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  31.2 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  31 
 
 		 554 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.4 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  31.08 
 
 		 1413 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  30.94 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  31.94 
 
 		 545 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  30.69 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  31.75 
 
 		 545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  30.06 
 
 		 531 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.8 
 
 		 506 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  29.59 
 
 		 566 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  30.98 
 
 		 738 aa  169  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  28.46 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  31.07 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  31.04 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  29.83 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  30.1 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  29.49 
 
 		 507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  29.1 
 
 		 507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.65 
 
 		 523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  28.88 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  29.75 
 
 		 1203 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.23 
 
 		 483 aa  160  7e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.6 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  31.03 
 
 		 553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.85 
 
 		 1418 aa  153  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  30.2 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  27.41 
 
 		 1220 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.72 
 
 		 754 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.68 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  28.34 
 
 		 551 aa  143  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.46 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  27.24 
 
 		 1267 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  29.44 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  38.6 
 
 		 705 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.13 
 
 		 574 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.06 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  26.06 
 
 		 818 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.51 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  26.46 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.18 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>