114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1258 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 1418 aa  2913    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.59 
 
 		 506 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  34.38 
 
 		 511 aa  233  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  37.06 
 
 		 572 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  28.47 
 
 		 1220 aa  228  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  34.66 
 
 		 738 aa  228  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  37.4 
 
 		 545 aa  225  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  37.4 
 
 		 545 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  34.91 
 
 		 554 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  34.25 
 
 		 544 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  34.91 
 
 		 554 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  34.52 
 
 		 554 aa  221  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  35.46 
 
 		 557 aa  221  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  34.52 
 
 		 554 aa  221  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  34.52 
 
 		 554 aa  221  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  34.52 
 
 		 554 aa  221  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  36.67 
 
 		 566 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  34.52 
 
 		 554 aa  218  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  35.58 
 
 		 507 aa  218  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  33.21 
 
 		 497 aa  213  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  36.36 
 
 		 545 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  33.58 
 
 		 1267 aa  206  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  32.03 
 
 		 507 aa  205  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  34.26 
 
 		 546 aa  201  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  32.49 
 
 		 531 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  31.79 
 
 		 818 aa  198  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  31.96 
 
 		 526 aa  196  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  31.47 
 
 		 1203 aa  192  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.72 
 
 		 1413 aa  190  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  31.27 
 
 		 551 aa  187  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.86 
 
 		 473 aa  180  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  30.55 
 
 		 492 aa  179  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  29.86 
 
 		 489 aa  169  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.74 
 
 		 491 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.46 
 
 		 480 aa  166  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.78 
 
 		 493 aa  164  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.57 
 
 		 507 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  37.1 
 
 		 705 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  27.74 
 
 		 480 aa  155  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.85 
 
 		 493 aa  153  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  29.47 
 
 		 473 aa  153  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  29.8 
 
 		 681 aa  153  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  28.93 
 
 		 576 aa  152  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.58 
 
 		 491 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.57 
 
 		 518 aa  149  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  26.69 
 
 		 476 aa  144  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  34.84 
 
 		 519 aa  144  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  26.89 
 
 		 476 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  28.97 
 
 		 432 aa  142  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  28.97 
 
 		 432 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.53 
 
 		 480 aa  141  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.36 
 
 		 454 aa  140  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  28.28 
 
 		 652 aa  139  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.44 
 
 		 480 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  28.38 
 
 		 664 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 440 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  33.87 
 
 		 472 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  28.08 
 
 		 740 aa  128  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  38.18 
 
 		 851 aa  123  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.48 
 
 		 487 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.81 
 
 		 754 aa  118  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.66 
 
 		 499 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.48 
 
 		 705 aa  114  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.04 
 
 		 481 aa  111  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.39 
 
 		 470 aa  107  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  30.11 
 
 		 553 aa  107  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.84 
 
 		 490 aa  106  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  24.61 
 
 		 473 aa  104  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.64 
 
 		 482 aa  104  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.98 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.51 
 
 		 566 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.74 
 
 		 469 aa  102  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  24.85 
 
 		 491 aa  102  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.16 
 
 		 470 aa  100  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.57 
 
 		 494 aa  99.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.57 
 
 		 494 aa  99.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  23.05 
 
 		 491 aa  98.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.67 
 
 		 489 aa  97.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.8 
 
 		 491 aa  96.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.59 
 
 		 491 aa  96.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.59 
 
 		 491 aa  96.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  23.29 
 
 		 487 aa  95.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.78 
 
 		 487 aa  94.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  23.79 
 
 		 523 aa  94.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  25 
 
 		 545 aa  94  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  24.21 
 
 		 546 aa  93.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.88 
 
 		 484 aa  93.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.31 
 
 		 511 aa  92.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.57 
 
 		 469 aa  92.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.55 
 
 		 787 aa  92.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.98 
 
 		 464 aa  91.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.95 
 
 		 427 aa  91.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.53 
 
 		 469 aa  90.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  29.55 
 
 		 451 aa  89.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  24.43 
 
 		 469 aa  89  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.93 
 
 		 464 aa  88.6  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  31.32 
 
 		 415 aa  87.8  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  30.32 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  26.7 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.97 
 
 		 479 aa  81.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>