111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0056 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  100 
 
 
415 aa  834    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  34.48 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.32 
 
 
511 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  27.59 
 
 
432 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  28.07 
 
 
432 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.96 
 
 
705 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  32.9 
 
 
523 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  33.93 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.46 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  33.02 
 
 
476 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  32.4 
 
 
476 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.17 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  24.53 
 
 
451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.89 
 
 
480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.65 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.72 
 
 
491 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  30.18 
 
 
740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.61 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.44 
 
 
518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.06 
 
 
470 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.83 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.54 
 
 
484 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.6 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.18 
 
 
493 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.79 
 
 
454 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  35.62 
 
 
480 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.36 
 
 
787 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  24.29 
 
 
487 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.77 
 
 
487 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.48 
 
 
464 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.8 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.15 
 
 
469 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.57 
 
 
481 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.74 
 
 
754 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.8 
 
 
470 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.51 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.56 
 
 
494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.56 
 
 
494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.06 
 
 
487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.32 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.79 
 
 
491 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.79 
 
 
491 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.45 
 
 
545 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.08 
 
 
491 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.27 
 
 
469 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  30.58 
 
 
507 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  29.94 
 
 
473 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  26.15 
 
 
467 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  26.79 
 
 
491 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.27 
 
 
818 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  27.08 
 
 
491 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  28.71 
 
 
519 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.07 
 
 
499 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.93 
 
 
490 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.4 
 
 
506 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  34.36 
 
 
511 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  26.98 
 
 
1413 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  26.27 
 
 
469 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.12 
 
 
566 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  30.72 
 
 
551 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  28.21 
 
 
554 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  26.65 
 
 
576 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  28.21 
 
 
554 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  29.01 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  27.92 
 
 
554 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  27.92 
 
 
554 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  27.92 
 
 
554 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  27.92 
 
 
554 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  26.1 
 
 
489 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  28.21 
 
 
554 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  25.12 
 
 
546 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.92 
 
 
473 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  21.82 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  26.68 
 
 
557 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  31.33 
 
 
526 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.87 
 
 
532 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  25.91 
 
 
497 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  28.01 
 
 
544 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  28.15 
 
 
705 aa  89.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  26.86 
 
 
545 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  31.06 
 
 
545 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  27.16 
 
 
531 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  24.53 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.32 
 
 
1418 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  31.49 
 
 
566 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  25.46 
 
 
507 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  26.14 
 
 
545 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  31.49 
 
 
572 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  30.97 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  24 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  26.67 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.27 
 
 
507 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  29.78 
 
 
738 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.77 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.91 
 
 
574 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  30.52 
 
 
1203 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.73 
 
 
489 aa  77  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.8 
 
 
851 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>