112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0683 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  100 
 
 		 473 aa  962    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  41.49 
 
 		 526 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  42.54 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  41.1 
 
 		 497 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  40.92 
 
 		 557 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  39.75 
 
 		 544 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  39.25 
 
 		 554 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  40.54 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  39.25 
 
 		 554 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  39.25 
 
 		 554 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  39.25 
 
 		 554 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  36.9 
 
 		 546 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  39.25 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  40.08 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  40.56 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  39.25 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  40.56 
 
 		 545 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  39.04 
 
 		 554 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  40.77 
 
 		 566 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  39.26 
 
 		 507 aa  302  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  36.08 
 
 		 1203 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  40.56 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  38.11 
 
 		 576 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  38.24 
 
 		 738 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.08 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  34.36 
 
 		 531 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  38.75 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.14 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  36.4 
 
 		 1220 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  37.5 
 
 		 472 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  56.2 
 
 		 851 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.69 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  44.94 
 
 		 705 aa  226  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  32.49 
 
 		 1267 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.68 
 
 		 1413 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  34.55 
 
 		 519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  32.22 
 
 		 652 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  30.29 
 
 		 664 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  34.24 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.16 
 
 		 491 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.6 
 
 		 493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  30.53 
 
 		 681 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.1 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.69 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  32.19 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  32.54 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  32.68 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.66 
 
 		 818 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.66 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.09 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.3 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.47 
 
 		 1418 aa  153  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  31.31 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  33.05 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.08 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.78 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.32 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.36 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.96 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  27.81 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  27.37 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  29.02 
 
 		 740 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.23 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.23 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.06 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.6 
 
 		 491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.22 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.68 
 
 		 705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.9 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.84 
 
 		 469 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.95 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  25.53 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  29.8 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  29.96 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  30.06 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl526  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.95 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.45 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  31.82 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0599  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  28.69 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.351504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  30.63 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  30.96 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.45 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.48 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.05 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.05 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3170  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.75 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.22 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.79 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  27.22 
 
 		 523 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.79 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.44 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.17 
 
 		 574 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.9 
 
 		 787 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.63 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.96 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.09 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.74 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  27.69 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.52 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>