62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1408 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1408  sucrose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 
503 aa  1039    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0712  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.72 
 
 
525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00405775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  26.88 
 
 
652 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0465  levanase  23.06 
 
 
554 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408145  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1985  levanase  23.06 
 
 
554 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  23.29 
 
 
554 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1011  levanase  23.06 
 
 
554 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0715  levanase  23.06 
 
 
554 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2101  levanase  23.03 
 
 
554 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0733  levanase  23.03 
 
 
554 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.70484  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  22.79 
 
 
557 aa  100  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6049  levanase  24.33 
 
 
544 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0213879  decreased coverage  0.0000000502192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  29.2 
 
 
664 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  31.14 
 
 
1220 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  29.12 
 
 
681 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2020  levanase  24.34 
 
 
546 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0275003  normal  0.946482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  23.09 
 
 
545 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  28.13 
 
 
1267 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  22.85 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0683  Levanase  22.15 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17900  beta-fructosidase, levanase/invertase  24.68 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  21.82 
 
 
545 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  22.22 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  27.1 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  22.81 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.97 
 
 
506 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4655  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.04 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.107095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  25.68 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  23.05 
 
 
1413 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  23.82 
 
 
738 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  26.92 
 
 
511 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  25.37 
 
 
1203 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3886  levanase  27.6 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2613  Levanase  24.76 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00261468  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3823  levanase  25.16 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  25.15 
 
 
526 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4712  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.11 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  26.93 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3269  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.48 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  25.86 
 
 
705 aa  64.3  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1884  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 
440 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00690154  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.35 
 
 
518 aa  63.5  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.29 
 
 
851 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  23.95 
 
 
421 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  23.78 
 
 
432 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5749  Beta-fructofuranosidase  26.06 
 
 
553 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57757  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  23.78 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  26.01 
 
 
519 aa  57  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.56 
 
 
1418 aa  57  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3595  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.42 
 
 
470 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.23 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.6 
 
 
484 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  20.89 
 
 
545 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.48 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.2 
 
 
491 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  20.06 
 
 
491 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.74 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.66 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.63 
 
 
480 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  20 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  22.76 
 
 
467 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  21.3 
 
 
566 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>