63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5354 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  77.99 
 
 		 957 aa  1567    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 951 aa  1977    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.01 
 
 		 1286 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.13 
 
 		 1084 aa  386  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.3 
 
 		 1193 aa  329  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.64 
 
 		 1274 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.21 
 
 		 1181 aa  198  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.49 
 
 		 1265 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.6 
 
 		 1162 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 		 705 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.91 
 
 		 1149 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.19 
 
 		 1068 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.47 
 
 		 1055 aa  175  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.41 
 
 		 1180 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.97 
 
 		 1171 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.48 
 
 		 1503 aa  153  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.04 
 
 		 1306 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.18 
 
 		 712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  25.65 
 
 		 1139 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.33 
 
 		 1390 aa  107  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.9 
 
 		 762 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.28 
 
 		 1040 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.76 
 
 		 749 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.36 
 
 		 759 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.26 
 
 		 1027 aa  92.8  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.12 
 
 		 868 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.77 
 
 		 852 aa  85.9  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.2 
 
 		 1201 aa  83.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  24.21 
 
 		 1058 aa  81.6  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.07 
 
 		 968 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  30.16 
 
 		 451 aa  77.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.78 
 
 		 1023 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  28.86 
 
 		 1110 aa  75.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.53 
 
 		 864 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.74 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.46 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  33.09 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  21.35 
 
 		 756 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  27.27 
 
 		 738 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.41 
 
 		 379 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  25.33 
 
 		 423 aa  55.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.77 
 
 		 371 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  29.33 
 
 		 705 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1217 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  30.28 
 
 		 435 aa  51.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 442 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  28.86 
 
 		 448 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  28.86 
 
 		 448 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 		 448 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  25.23 
 
 		 1439 aa  48.5  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  23.94 
 
 		 396 aa  48.1  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  29.17 
 
 		 446 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  21.52 
 
 		 371 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  27.94 
 
 		 438 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  21.9 
 
 		 384 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.75 
 
 		 381 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2506  hypothetical protein  31.76 
 
 		 738 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  29.58 
 
 		 446 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 430 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 		 446 aa  45.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  27.92 
 
 		 514 aa  45.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.92 
 
 		 377 aa  45.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  28.87 
 
 		 444 aa  44.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>