87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0666 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.59 
 
 		 1149 aa  764    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.98 
 
 		 1162 aa  841    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1181 aa  2407    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.36 
 
 		 1306 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.52 
 
 		 1055 aa  337  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.95 
 
 		 1068 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  32.79 
 
 		 1139 aa  294  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.19 
 
 		 1286 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 1390 aa  229  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.43 
 
 		 1027 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.39 
 
 		 1171 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.39 
 
 		 1040 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 		 1274 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 		 1193 aa  201  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.55 
 
 		 1265 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.93 
 
 		 1180 aa  197  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.25 
 
 		 957 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.16 
 
 		 1201 aa  194  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.96 
 
 		 951 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.01 
 
 		 1110 aa  186  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.79 
 
 		 1503 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.6 
 
 		 1084 aa  180  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 		 868 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.81 
 
 		 705 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  23.89 
 
 		 1058 aa  157  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  22.71 
 
 		 1143 aa  151  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.87 
 
 		 968 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.18 
 
 		 1023 aa  149  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  24.73 
 
 		 756 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.89 
 
 		 852 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  21.72 
 
 		 1141 aa  121  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.43 
 
 		 1439 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.86 
 
 		 762 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.78 
 
 		 759 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  21.83 
 
 		 1137 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.95 
 
 		 749 aa  99  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.28 
 
 		 864 aa  96.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.15 
 
 		 773 aa  94  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.83 
 
 		 712 aa  93.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  31.55 
 
 		 924 aa  81.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  33.82 
 
 		 1142 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  29.17 
 
 		 874 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  29.25 
 
 		 880 aa  74.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  29.05 
 
 		 898 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  32.62 
 
 		 1077 aa  71.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  26.47 
 
 		 902 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.63 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  23.8 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  22.37 
 
 		 381 aa  62  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.45 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.08 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.05 
 
 		 369 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.69 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 460 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  25.32 
 
 		 363 aa  55.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.93 
 
 		 386 aa  54.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.12 
 
 		 168 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.07 
 
 		 373 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.07 
 
 		 379 aa  52.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.13 
 
 		 371 aa  51.6  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  28 
 
 		 430 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  29.32 
 
 		 473 aa  51.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  22.28 
 
 		 418 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  28.67 
 
 		 430 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.64 
 
 		 390 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3736  hypothetical protein  29.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.64 
 
 		 390 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.64 
 
 		 390 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.64 
 
 		 390 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  28.48 
 
 		 430 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.89 
 
 		 433 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  28.48 
 
 		 430 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.67 
 
 		 448 aa  48.9  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  27.55 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  27.81 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  23.93 
 
 		 398 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.14 
 
 		 361 aa  47.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.87 
 
 		 384 aa  47.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  23.92 
 
 		 396 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  24.87 
 
 		 416 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  24.17 
 
 		 423 aa  46.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  39.62 
 
 		 104 aa  46.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  27.89 
 
 		 377 aa  45.8  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  23.34 
 
 		 546 aa  45.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.46 
 
 		 387 aa  44.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>