165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1972 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  100 
 
 		 1110 aa  2266    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  35.06 
 
 		 1141 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  35.05 
 
 		 1143 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  34.41 
 
 		 1137 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  26.46 
 
 		 1058 aa  223  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.14 
 
 		 1201 aa  211  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.13 
 
 		 1040 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.86 
 
 		 1162 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.01 
 
 		 1181 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.35 
 
 		 1027 aa  167  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.56 
 
 		 1193 aa  159  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.52 
 
 		 1084 aa  157  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.67 
 
 		 1286 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.31 
 
 		 868 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.94 
 
 		 1503 aa  125  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.66 
 
 		 968 aa  124  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  24.9 
 
 		 1439 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.07 
 
 		 705 aa  108  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.03 
 
 		 1023 aa  106  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.08 
 
 		 1149 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.62 
 
 		 1180 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.31 
 
 		 864 aa  104  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.09 
 
 		 1274 aa  94.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 		 712 aa  94.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  25.42 
 
 		 874 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1171 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 		 1343 aa  87.8  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.02 
 
 		 1306 aa  88.2  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.29 
 
 		 1390 aa  87.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  26.26 
 
 		 880 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.44 
 
 		 1265 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.75 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.54 
 
 		 1068 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  36.5 
 
 		 1142 aa  79  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  32.9 
 
 		 1139 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.99 
 
 		 957 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  30.77 
 
 		 902 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.86 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.06 
 
 		 1055 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  33.33 
 
 		 898 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  24.73 
 
 		 756 aa  71.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35 
 
 		 491 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.77 
 
 		 958 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.16 
 
 		 852 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  27.49 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  25.83 
 
 		 1077 aa  68.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  31.16 
 
 		 924 aa  67.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.64 
 
 		 168 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.44 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.44 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.44 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.99 
 
 		 438 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1094 aa  58.9  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  31.06 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 430 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  27.96 
 
 		 642 aa  57  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.1 
 
 		 371 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 530 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  32.43 
 
 		 416 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  30.49 
 
 		 430 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 		 430 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1224 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  30.49 
 
 		 430 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  27.88 
 
 		 411 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0961  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.63 
 
 		 392 aa  55.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  25.88 
 
 		 381 aa  55.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.94 
 
 		 546 aa  55.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  41.18 
 
 		 443 aa  55.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  33.33 
 
 		 501 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  23.88 
 
 		 493 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 		 429 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  35.95 
 
 		 1133 aa  54.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.82 
 
 		 457 aa  54.3  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.36 
 
 		 1148 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.72 
 
 		 666 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  27.45 
 
 		 438 aa  53.5  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.14 
 
 		 436 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 448 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  26.42 
 
 		 444 aa  53.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.06 
 
 		 428 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.06 
 
 		 428 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  31.37 
 
 		 430 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  30.21 
 
 		 396 aa  52.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  29.96 
 
 		 460 aa  52.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  24.23 
 
 		 644 aa  52.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  35 
 
 		 646 aa  52.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 		 430 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  27.45 
 
 		 448 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  26.41 
 
 		 423 aa  52  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.44 
 
 		 427 aa  52  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  37.8 
 
 		 428 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  37.8 
 
 		 428 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 		 448 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  24.9 
 
 		 407 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.41 
 
 		 391 aa  51.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.4 
 
 		 232 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  28.52 
 
 		 446 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.28 
 
 		 433 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 		 432 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>