105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1564 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1193 aa  2456    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.42 
 
 		 1084 aa  393  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.4 
 
 		 1286 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.5 
 
 		 957 aa  341  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.12 
 
 		 951 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.46 
 
 		 1503 aa  270  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.1 
 
 		 1265 aa  215  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.32 
 
 		 1180 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.54 
 
 		 1274 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 		 1181 aa  200  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.25 
 
 		 1162 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.93 
 
 		 1171 aa  194  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.54 
 
 		 1149 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.9 
 
 		 1055 aa  171  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.21 
 
 		 1306 aa  168  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 		 1201 aa  167  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.56 
 
 		 1110 aa  167  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29 
 
 		 1068 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.24 
 
 		 705 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.71 
 
 		 712 aa  141  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  28.54 
 
 		 1139 aa  140  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.44 
 
 		 759 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.37 
 
 		 1027 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 868 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.8 
 
 		 1040 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.2 
 
 		 968 aa  119  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.85 
 
 		 1023 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.04 
 
 		 1390 aa  112  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.77 
 
 		 749 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.85 
 
 		 762 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.17 
 
 		 852 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  26.63 
 
 		 1058 aa  99.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  25.2 
 
 		 756 aa  96.3  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.89 
 
 		 773 aa  95.9  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 		 864 aa  89  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  24.3 
 
 		 1143 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  33.33 
 
 		 924 aa  79.7  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.14 
 
 		 436 aa  72  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  29.8 
 
 		 1142 aa  71.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0528  hypothetical protein  30 
 
 		 972 aa  71.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.06 
 
 		 379 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.8 
 
 		 384 aa  67.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  25 
 
 		 880 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  26.11 
 
 		 874 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  25.37 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  23.98 
 
 		 1141 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  26.32 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  22.87 
 
 		 1439 aa  62.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.74 
 
 		 371 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  29.63 
 
 		 898 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  32.37 
 
 		 1077 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  27.54 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  22.87 
 
 		 381 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  22.99 
 
 		 435 aa  57.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.3 
 
 		 466 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  23.7 
 
 		 448 aa  57  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  25.18 
 
 		 446 aa  56.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  27.69 
 
 		 902 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  23.13 
 
 		 1137 aa  55.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  22.72 
 
 		 546 aa  54.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  23.33 
 
 		 448 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  24.32 
 
 		 421 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  22.33 
 
 		 440 aa  53.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.35 
 
 		 371 aa  52.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  24 
 
 		 438 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.16 
 
 		 403 aa  51.6  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.16 
 
 		 403 aa  51.6  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  22.96 
 
 		 448 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  24.39 
 
 		 408 aa  51.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  22.06 
 
 		 448 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  24.8 
 
 		 460 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.44 
 
 		 423 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.53 
 
 		 361 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  23.95 
 
 		 448 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  24.24 
 
 		 446 aa  49.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  27.06 
 
 		 461 aa  49.3  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  23.15 
 
 		 433 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  23.4 
 
 		 447 aa  48.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  24.53 
 
 		 514 aa  47.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  25.19 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  25.86 
 
 		 446 aa  47.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  23.1 
 
 		 442 aa  48.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  25.38 
 
 		 445 aa  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  21.45 
 
 		 439 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.93 
 
 		 362 aa  47  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.17 
 
 		 386 aa  46.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  23.86 
 
 		 465 aa  46.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.13 
 
 		 369 aa  46.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  24.9 
 
 		 423 aa  46.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  23.94 
 
 		 439 aa  46.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  23.37 
 
 		 442 aa  46.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  23.28 
 
 		 439 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  24.31 
 
 		 451 aa  46.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  28.39 
 
 		 430 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.66 
 
 		 388 aa  45.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.5 
 
 		 373 aa  45.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  24.3 
 
 		 456 aa  45.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  28.76 
 
 		 430 aa  45.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>