142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1373 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.59 
 
 		 1181 aa  781    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  66.9 
 
 		 1162 aa  1554    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1149 aa  2335    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.79 
 
 		 1306 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 		 1055 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.48 
 
 		 1068 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  32.61 
 
 		 1139 aa  297  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.93 
 
 		 1027 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.76 
 
 		 1286 aa  254  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.02 
 
 		 1390 aa  249  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.86 
 
 		 1503 aa  246  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.86 
 
 		 1201 aa  211  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.31 
 
 		 1180 aa  204  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.47 
 
 		 1274 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.92 
 
 		 1265 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.45 
 
 		 1171 aa  195  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.52 
 
 		 1040 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.54 
 
 		 1193 aa  185  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.28 
 
 		 957 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.68 
 
 		 968 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.72 
 
 		 1084 aa  174  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.75 
 
 		 868 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.48 
 
 		 951 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  23.44 
 
 		 1110 aa  163  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.09 
 
 		 1023 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  27.18 
 
 		 756 aa  152  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  23.13 
 
 		 1143 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  23.24 
 
 		 1141 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.55 
 
 		 852 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.28 
 
 		 759 aa  121  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.35 
 
 		 762 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.52 
 
 		 705 aa  115  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 749 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  25.33 
 
 		 1058 aa  102  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  24.95 
 
 		 1439 aa  98.2  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.48 
 
 		 712 aa  97.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.71 
 
 		 864 aa  94  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  21.69 
 
 		 1137 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  31.91 
 
 		 874 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.95 
 
 		 773 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  29.79 
 
 		 880 aa  85.1  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.78 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  28.88 
 
 		 924 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  33.6 
 
 		 902 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  30.15 
 
 		 898 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.99 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 		 430 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  22.76 
 
 		 381 aa  64.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  25.39 
 
 		 363 aa  64.3  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.6 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.72 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.13 
 
 		 168 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.78 
 
 		 380 aa  62  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 430 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.99 
 
 		 386 aa  60.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.6 
 
 		 369 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  21.43 
 
 		 384 aa  60.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.8 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  29.68 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  24.67 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  24.67 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  23.68 
 
 		 1142 aa  58.9  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.58 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.25 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  23.76 
 
 		 502 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  27.74 
 
 		 430 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  27.56 
 
 		 430 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  29.89 
 
 		 514 aa  55.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  27.08 
 
 		 1077 aa  55.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.17 
 
 		 448 aa  55.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  24.44 
 
 		 438 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.34 
 
 		 403 aa  54.3  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.34 
 
 		 403 aa  54.3  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 		 433 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  23.66 
 
 		 418 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.78 
 
 		 373 aa  54.3  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.59 
 
 		 456 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.7 
 
 		 367 aa  53.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.57 
 
 		 391 aa  53.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.2 
 
 		 390 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.38 
 
 		 361 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.2 
 
 		 390 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.2 
 
 		 390 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.71 
 
 		 390 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.48 
 
 		 391 aa  52.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  28.08 
 
 		 446 aa  52.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  26.99 
 
 		 435 aa  52  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  25.38 
 
 		 642 aa  51.6  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  27.61 
 
 		 525 aa  51.6  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  23.89 
 
 		 422 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 		 447 aa  50.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  24.28 
 
 		 433 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  36.63 
 
 		 421 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.26 
 
 		 391 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  32.03 
 
 		 439 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.29 
 
 		 429 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.54 
 
 		 391 aa  49.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>