159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4698 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  47.36 
 
 		 1265 aa  799    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  53.32 
 
 		 1171 aa  1272    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  46.3 
 
 		 1274 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1180 aa  2441    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.9 
 
 		 1503 aa  602  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.66 
 
 		 712 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.95 
 
 		 705 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.32 
 
 		 1193 aa  213  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.96 
 
 		 1162 aa  201  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.93 
 
 		 1181 aa  197  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.98 
 
 		 1149 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.62 
 
 		 1306 aa  196  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.98 
 
 		 1068 aa  192  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.71 
 
 		 1055 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.31 
 
 		 762 aa  169  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.12 
 
 		 852 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.19 
 
 		 759 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.41 
 
 		 951 aa  163  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.95 
 
 		 957 aa  162  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  28.85 
 
 		 1139 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.29 
 
 		 773 aa  158  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 756 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.22 
 
 		 1084 aa  154  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.91 
 
 		 1286 aa  153  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.64 
 
 		 749 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.6 
 
 		 1040 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.42 
 
 		 968 aa  141  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28 
 
 		 1027 aa  141  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.43 
 
 		 1390 aa  131  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 868 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.15 
 
 		 1023 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.96 
 
 		 1201 aa  108  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.62 
 
 		 1110 aa  104  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  44.25 
 
 		 673 aa  98.6  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  32.35 
 
 		 219 aa  95.1  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  42.11 
 
 		 669 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  31.46 
 
 		 296 aa  88.6  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.72 
 
 		 1439 aa  87.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  40.16 
 
 		 373 aa  87.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  26.78 
 
 		 1143 aa  82.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 1151 aa  81.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  33.63 
 
 		 722 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  28.63 
 
 		 1058 aa  78.2  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  36.72 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  30.16 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  28.71 
 
 		 1135 aa  75.1  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1138 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  38.19 
 
 		 165 aa  74.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  29.03 
 
 		 260 aa  73.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  23.95 
 
 		 245 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.38 
 
 		 1444 aa  73.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  30.06 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  29.23 
 
 		 351 aa  72  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  33.1 
 
 		 213 aa  72  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  29.89 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  29.89 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  34.65 
 
 		 159 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  34.13 
 
 		 159 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  26.69 
 
 		 285 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  35.19 
 
 		 147 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  28.57 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  34 
 
 		 179 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  27.85 
 
 		 223 aa  67.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  27.57 
 
 		 279 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  28.04 
 
 		 217 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  26.74 
 
 		 1142 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  24.46 
 
 		 1137 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  33.61 
 
 		 161 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  27.22 
 
 		 1182 aa  66.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.31 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  26.65 
 
 		 1141 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  24.63 
 
 		 1194 aa  65.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  34.53 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  23.65 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  34.75 
 
 		 173 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  28.43 
 
 		 255 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.71 
 
 		 419 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  33.93 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  23.01 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  23.01 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.91 
 
 		 436 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 232 aa  62  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  23.2 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  24.88 
 
 		 346 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  21.53 
 
 		 377 aa  60.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  35.25 
 
 		 164 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  27.69 
 
 		 217 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.19 
 
 		 361 aa  60.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  25.62 
 
 		 1143 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  25.76 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  20.93 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  27.32 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  29.41 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  21.94 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  28.95 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>