60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2909 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2909  azurin  100 
 
 		 165 aa  331  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  60 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  49.6 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  41.28 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  52.07 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  52.07 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  52.07 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  52.07 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  44.72 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  41.45 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  43.61 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  43.9 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  46.4 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  44.72 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  45 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  44.35 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  43.55 
 
 		 151 aa  97.8  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  41.67 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  41.67 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  50.83 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  41.67 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  41.46 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  37.4 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  41.09 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  49.59 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  37.5 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  40 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  35.71 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  34.92 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  41.03 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  41.35 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  39.85 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  33.07 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  36.72 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  36.72 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.88 
 
 		 1390 aa  80.5  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  36.77 
 
 		 673 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  37.3 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.78 
 
 		 1180 aa  77.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  33.86 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  33.86 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  39.2 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  35 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  36.67 
 
 		 669 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  30.63 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  30.89 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.75 
 
 		 1265 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  35.34 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 722 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.44 
 
 		 1306 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  30.3 
 
 		 358 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 		 1274 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  28.8 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.77 
 
 		 1171 aa  58.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  26.74 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  27.44 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>