37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02570 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  100 
 
 
346 aa  701    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
232 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  38.49 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.74 
 
 
1505 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  36.02 
 
 
392 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  30 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  30.38 
 
 
1138 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  33.46 
 
 
1444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
272 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  29 
 
 
247 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  31.54 
 
 
1151 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
800 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  31.6 
 
 
275 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  33.33 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  31.62 
 
 
1143 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  32.94 
 
 
1135 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  31.3 
 
 
1142 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  30.08 
 
 
1182 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  30.08 
 
 
279 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  29.53 
 
 
895 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  28.1 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  30.24 
 
 
375 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.2 
 
 
1200 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.46 
 
 
1194 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  27.41 
 
 
296 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.94 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.88 
 
 
1180 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.4 
 
 
1274 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.28 
 
 
1265 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 
1171 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  23.4 
 
 
266 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  24.78 
 
 
351 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.31 
 
 
1503 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.73 
 
 
223 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>