51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2908 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  100 
 
 		 266 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  58.87 
 
 		 258 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  59.36 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.38 
 
 		 601 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 1505 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  33.18 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 		 1200 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  31.71 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  29.15 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.06 
 
 		 1444 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  30.24 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  27.51 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  30.09 
 
 		 639 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  27.92 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  29.26 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  29.54 
 
 		 1135 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.17 
 
 		 392 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  28.05 
 
 		 1151 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  25.48 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.38 
 
 		 1138 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  28.4 
 
 		 1143 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  30.51 
 
 		 1182 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  29.49 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.12 
 
 		 1142 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  26.64 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  26.87 
 
 		 895 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  27.54 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  24.75 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  22.94 
 
 		 1194 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  25.62 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  22.82 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  24.78 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  21.69 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  23.4 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  24.68 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  30.63 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  25.1 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.37 
 
 		 1265 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  27.52 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  22.5 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  23.83 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.62 
 
 		 1171 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  23.98 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  23.5 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  28.1 
 
 		 306 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>