14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3471 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  26.82 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  25.89 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  22.32 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  25 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  24.8 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  23.83 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  25.7 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.22 
 
 		 1444 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  29.83 
 
 		 558 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.67 
 
 		 1274 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  25 
 
 		 478 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  24.44 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  23.6 
 
 		 232 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>