52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1906 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  35.56 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  27.39 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  28.31 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.52 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  34.59 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  33.87 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  26.99 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  31.16 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  30.52 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.79 
 
 
1171 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.18 
 
 
1274 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25.1 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.32 
 
 
1265 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  20.93 
 
 
1180 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.99 
 
 
1503 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  24 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  24 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  25.71 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  25.71 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  25.71 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  27.4 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  25.32 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  26.74 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  24.47 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  24.47 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  35.71 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  24.72 
 
 
326 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  26.71 
 
 
296 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  24.52 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 
1505 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  22.94 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  24.64 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  24.72 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  22.94 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  26.55 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  28.28 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  22.01 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  24.2 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  25.1 
 
 
266 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  22.09 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  24.11 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.72 
 
 
1182 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.22 
 
 
1135 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  28.71 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  31.91 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  23.32 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  25.84 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  26.85 
 
 
1439 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  24.03 
 
 
233 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  30.34 
 
 
558 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>