36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0627 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
558 aa  1158    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2054  signal peptide  49.45 
 
 
304 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  42.96 
 
 
514 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  45.42 
 
 
258 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  43.43 
 
 
259 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000246514  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
515 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  32.92 
 
 
217 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  30.81 
 
 
212 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  30.23 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  31.2 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  31.54 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.85 
 
 
1505 aa  63.9  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  31.23 
 
 
244 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  28.97 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.82 
 
 
241 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
198 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.62 
 
 
238 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  26.27 
 
 
216 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  26.41 
 
 
215 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.22 
 
 
247 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
198 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25 
 
 
501 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.74 
 
 
1274 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  26.94 
 
 
239 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  25.1 
 
 
261 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  23.87 
 
 
226 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.95 
 
 
234 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  24.46 
 
 
1140 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 
211 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  27.86 
 
 
222 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  37.33 
 
 
451 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.77 
 
 
1444 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.03 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>