47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2385 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  54.84 
 
 
212 aa  215  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  45.5 
 
 
218 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  32.89 
 
 
453 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  39.36 
 
 
211 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  35.38 
 
 
440 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  35.6 
 
 
452 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  32.92 
 
 
558 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  30.99 
 
 
515 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  33.16 
 
 
451 aa  91.7  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  31.9 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  34.76 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  35.94 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  32.78 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  31.67 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  27.49 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
1145 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  25.69 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.63 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.73 
 
 
453 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.9 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.42 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
451 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  24.67 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.71 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  31.31 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  28.78 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.09 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 
1140 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  20.37 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  24.7 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.05 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  23.77 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 
261 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  24.19 
 
 
257 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.16 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.79 
 
 
501 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  25.36 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  25.81 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.09 
 
 
241 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.92 
 
 
1444 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>