56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1060 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 260 aa  537  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  44.39 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  40.23 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  34.1 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  44.19 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  43.87 
 
 		 226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  39.35 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  34.85 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  35.21 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  35.47 
 
 		 452 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  38.71 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  36.97 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  37.68 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  37.43 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  35.91 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  39.32 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  37.66 
 
 		 440 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  31.65 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  32.2 
 
 		 455 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  35.24 
 
 		 453 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  29.72 
 
 		 1140 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  28.64 
 
 		 1145 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  27.8 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.91 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  28.82 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.2 
 
 		 1444 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  30.14 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  25.78 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.42 
 
 		 1505 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  25.12 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  26.85 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  22.58 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  23.2 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  26.96 
 
 		 453 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  23.85 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.41 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  22.27 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.77 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  24 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  22.63 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  25.76 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  20.91 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  28.46 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  26.81 
 
 		 482 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  21.19 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  23.46 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  21.08 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>