65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1742 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
241 aa  501  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  45.67 
 
 
234 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  46.34 
 
 
261 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  49.49 
 
 
222 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  45.27 
 
 
230 aa  177  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  34.1 
 
 
260 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  37.93 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  48.66 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  38.34 
 
 
247 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  37.56 
 
 
237 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  35 
 
 
239 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  40.38 
 
 
226 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  37.56 
 
 
239 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  39.8 
 
 
238 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  38.6 
 
 
440 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  39.52 
 
 
452 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  34.58 
 
 
455 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  35.48 
 
 
453 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  31.56 
 
 
242 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  31.96 
 
 
1140 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  30.77 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  30.65 
 
 
1145 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
451 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 
1505 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  34.35 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.86 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  28.44 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  24.15 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  28.77 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  27.92 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  29.92 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  31.07 
 
 
1444 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  27.82 
 
 
558 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  29.09 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.66 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.38 
 
 
322 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  27.52 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  23.08 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  27.71 
 
 
1194 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.55 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  27.21 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.7 
 
 
453 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  26.41 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  27.01 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  29.03 
 
 
501 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  25.12 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  24.18 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  24.53 
 
 
326 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  23.25 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  27.92 
 
 
515 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  24.62 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 
321 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  27.09 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  25.23 
 
 
451 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2675  hypothetical protein  45 
 
 
242 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.912699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>