25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0813 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.22 
 
 
451 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  28.05 
 
 
1140 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.57 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  25.24 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  28.65 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
321 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 
1505 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  28.08 
 
 
1046 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  25.13 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.72 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 
322 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  26.26 
 
 
326 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.37 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.88 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.54 
 
 
1145 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.85 
 
 
1444 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  24.59 
 
 
629 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  24.87 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  20.98 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  25.28 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  22.77 
 
 
1194 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.44 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  24.32 
 
 
214 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>