31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1879 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 629 aa  1298    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  39.38 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  38.05 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  54.55 
 
 		 482 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  30.58 
 
 		 579 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  51.61 
 
 		 478 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  29.55 
 
 		 563 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  39.26 
 
 		 322 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  34.6 
 
 		 281 aa  94  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 268 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  36.31 
 
 		 345 aa  89  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  36.21 
 
 		 255 aa  88.2  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  34.73 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  32.02 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  34.71 
 
 		 321 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  37.42 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  29.27 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  32.4 
 
 		 326 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  28.78 
 
 		 254 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  37.41 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  29.94 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  32.06 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 		 255 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  29.81 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  33.58 
 
 		 325 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  26.58 
 
 		 308 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 		 260 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  27.42 
 
 		 1145 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  30.4 
 
 		 263 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  23.12 
 
 		 969 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  24.59 
 
 		 240 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>