11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6139 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1143    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  39.6 
 
 		 579 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  29.65 
 
 		 595 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  28.13 
 
 		 628 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  29.55 
 
 		 629 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  33.18 
 
 		 482 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  23.41 
 
 		 969 aa  54.7  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  32.14 
 
 		 578 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  23.89 
 
 		 828 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  26.19 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>