31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3235 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 595 aa  1224    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  49.58 
 
 		 628 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  38.05 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  57.71 
 
 		 482 aa  257  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  51.39 
 
 		 478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  29.65 
 
 		 563 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  31.46 
 
 		 579 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  32.9 
 
 		 345 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  33.13 
 
 		 322 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  28.71 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  31.38 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  30.82 
 
 		 321 aa  73.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  32.72 
 
 		 786 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  34.25 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  30.54 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  34.39 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  31.47 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  30.94 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1438  hypothetical protein  25.91 
 
 		 828 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.45862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  35.07 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  27.51 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  30.2 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30.86 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  29.37 
 
 		 969 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  30.87 
 
 		 255 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  27.1 
 
 		 259 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  28.81 
 
 		 263 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  23.28 
 
 		 260 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  24.63 
 
 		 1206 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>