46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5826 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  64.68 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  55.6 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  55.32 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  48.8 
 
 		 268 aa  238  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  47.88 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  49.23 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  50.22 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  50.45 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  49.37 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  44.07 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  40.1 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  33.97 
 
 		 540 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  34.82 
 
 		 786 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  31.4 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  31.84 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  32.02 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  35.57 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 		 629 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  28.76 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.96 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  32.89 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.29 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.11 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  25.81 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.93 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  30.87 
 
 		 595 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.23 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  30.61 
 
 		 628 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  24.67 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  23.92 
 
 		 1140 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  25.65 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  27.54 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  27.93 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 		 451 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  25.89 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  29.5 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  25.33 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  29.54 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.93 
 
 		 1505 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.44 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  24 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.82 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 		 1444 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  24.24 
 
 		 453 aa  42  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>