40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00436 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  100 
 
 
281 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  63.67 
 
 
254 aa  340  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  57.6 
 
 
247 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  53.68 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  46.92 
 
 
268 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  52.53 
 
 
255 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  50.88 
 
 
259 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  49.37 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  46.34 
 
 
352 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  52.28 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  39.54 
 
 
258 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  40.91 
 
 
540 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  33.02 
 
 
786 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  37.75 
 
 
345 aa  95.9  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  34.6 
 
 
629 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  34.78 
 
 
325 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  36.72 
 
 
482 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  32.74 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  28.71 
 
 
595 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.79 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  29.26 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  30.59 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.85 
 
 
478 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 
628 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.75 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  31.91 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.06 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  29.3 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 
234 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  22.82 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.27 
 
 
451 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  25.77 
 
 
193 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  23.25 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.92 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  22.63 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.16 
 
 
1145 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.59 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  20.99 
 
 
1140 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  24.75 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.7 
 
 
238 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>