55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2324 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  47.54 
 
 
326 aa  258  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  44.37 
 
 
322 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  42.51 
 
 
321 aa  235  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  27.76 
 
 
1140 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  29.11 
 
 
1145 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  32.82 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  32.6 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  30.86 
 
 
193 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  31.66 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  29.84 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  31.28 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  34.15 
 
 
352 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  31.21 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  31.91 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  30.86 
 
 
595 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  31.13 
 
 
198 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 
451 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  30 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  30.92 
 
 
198 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  29.27 
 
 
482 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  27.39 
 
 
786 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  31.13 
 
 
211 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  28.25 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  24.72 
 
 
216 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  32.93 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  29.5 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  27.5 
 
 
628 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  25.67 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  26.18 
 
 
451 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  30.06 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  26.58 
 
 
629 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  28.17 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  27.92 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  30.82 
 
 
455 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.81 
 
 
239 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  29.29 
 
 
325 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  31.72 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  30 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  25.93 
 
 
478 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  27 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  26.45 
 
 
218 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  28.12 
 
 
258 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.45 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  30.26 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  27.63 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1383  hypothetical protein  22.96 
 
 
218 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  23.87 
 
 
242 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0311  LemA family protein  27.18 
 
 
201 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0316  LemA family protein  27.18 
 
 
201 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.65 
 
 
1444 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  25.66 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>